average_spectra

Calculates an average of two or more spectra.
Calcule la moyenne de deux spectres ou plus.

The goal of 'PlotFTIR' is to easily and quickly kick-start the production of journal-quality Fourier Transform Infra-Red (FTIR) spectral plots in R using 'ggplot2'. The produced plots can be published directly or further modified by 'ggplot2' functions.
L'objectif de 'PlotFTIR' est de démarrer facilement et rapidement la production des tracés spectraux de spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier (IRTF) de qualité journal dans R à l'aide de 'ggplot2'. Les tracés produits peuvent être publiés directement ou modifiés davantage par les fonctions 'ggplot2'.

Philip Bulsink

PlotFTIR

Plot FTIR Spectra

Ulrich Makanda

His Majesty the King in Right of Canada, as represented by the Minister of Natural Resources 

average_spectra function

<dl><dt>ftir</dt>
<dd>A data.frame of FTIR spectral data including spectra to be
converted.
Un data.frame de données spectrales IRTF comprenant les spectres à
convertir.</dd>
<dt>sample_ids</dt>
<dd>A vector of sample IDs to be averaged together. All sample
IDs must be present in the <code>ftir</code> data.frame. If averaging all spectra,
provide <code>NA</code> or <code>NULL.</code>
Un vecteur d'identifiants d'échantillons dont la moyenne doit être
calculée.. Tous les identifiants des échantillons doivent être présents
dans le data.frame <code>ftir</code>. Si la moyenne est calculée pour tous les
spectres, indiquez <code>NA</code> ou <code>NULL.</code></dd>
<dt>average_id</dt>
<dd>The name to be used as <code>sample_id</code> for the averaged
spectra.
Le nom à utiliser en tant que <code>sample_id</code> pour les spectres moyennés.</dd></dl>

Arguments

Average FTIR Spectra — average_spectra

<dl>

<dt>ftir</dt>
<dd>A data.frame of FTIR spectral data including spectra to be
converted.
Un data.frame de données spectrales IRTF comprenant les spectres à
convertir.</dd>


<dt>sample_ids</dt>
<dd>A vector of sample IDs to be averaged together. All sample
IDs must be present in the <code>ftir</code> data.frame. If averaging all spectra,
provide <code>NA</code> or <code>NULL.</code>
Un vecteur d'identifiants d'échantillons dont la moyenne doit être
calculée.. Tous les identifiants des échantillons doivent être présents
dans le data.frame <code>ftir</code>. Si la moyenne est calculée pour tous les
spectres, indiquez <code>NA</code> ou <code>NULL.</code></dd>


<dt>average_id</dt>
<dd>The name to be used as <code>sample_id</code> for the averaged
spectra.
Le nom à utiliser en tant que <code>sample_id</code> pour les spectres moyennés.</dd>

</dl>

average_spectra: Average FTIR Spectra

Description

Usage

Value

Arguments

Examples